
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究最后
科研拜谱生物探索伴随保温耗时拉长羊肉的对抗强度、持反击式水轮机、色度、自由铁含氧量、ROS、脂质过被化合物、MDA、GSH和GPX4的水平来评估报告肌肤组识肿瘤组织的铁伤亡情形。数据凸显,保温耗时拉长后,羊肉的对抗强度在第六天和第6天强势越来越低;持水功能降低;色变深,抛弃油润,鲜粉橙红色转变成暗粉橙红色。不仅如此,自由铁、灵活性氧和MDA的含氧量强势加强,肿瘤组织凋亡率强势提高。 研究探讨考生提现的各个食品冷藏的时间的身体力量检样管理英文的蛋清质,第三做出SDS-PAGE概述,蛋清质条带在的各个一时期分布图饱满且类似的(图1a)。按照其蛋清在的各个检样管理英文中的表示具体情况,概述遇到同时组检样管理英文的中六位数比较敏感于同时平均水平(图1b),详细说明身体力量检样管理英文蛋清质具备有优质的组内类似的性和组间差别性。 淀粉酶质组学共签别出1996种淀粉酶质。以B0为照表组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶实行地域区别表示数据定量分析,共签别到37七个DEPs。将火山图可视化效果,并由于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根标准的数据定量分析DEP。的结果彰显如图已知1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别签别出22、33、73和140个DEPs,至少分发型别调整6、11、32和8九个,上涨16、22、41和51个。聚类分析最简单的方法考评了多种冷藏箱时段脂肪组识中淀粉酶质的表示,的结果彰显彰显脂肪淀粉酶表示地域区别由于永久保存时间段的增添而增添(图1g)。
图1| 各种不同冷冻时间段的腿部肌肉样件蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不一致性保鲜冷库用时的肌群原辅料不一致性核蛋白数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频蛋白质肽的PRM一定量阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 为KEGG含有地域差异表示淀粉酶的铁去世新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT按量核氨基酸组学技巧贴心服务管理,拜谱生态学已生产制造结束并设立了落实发育成熟的转录组学、核蛋白酶组学、分解代谢组学及多个学联动品牌技巧贴心服务管理管理体系,欢迎致电咨询!
可以参考期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.